В 1966 году при ЛГПИ имени С.м.Кирова (ныне ХГУ) был образован факультет физического воспитания. В первом учебном году был принят 51 студент, ониобучались в русской и таджикской группах. Первым деканом был Дадоджон Ботурович Ботуров. В период его руководства факультетом( 1966-1972 ) количество студентов увеличилось до 400 человек. В то время на факультете функционировала только одна кафедра «Теория и методикапреподаванияфизического воспитания» , которойруководил Каримов А.К.

В 1973 году факультет физического воспитаниябыл расформированв связи с тем, что в городе Душанбе был открыт Институт физической культуры, а студенты, чтобы продолжитьучёбу, направлялись в столицу. После обретения Независимости в 1995 годуна базе общеуниверситетской кафедры физического воспитания, который находилсяв составе факультета педагогики, было создано отделение физического воспитания с двумя группами.

10 мая 2011 года Приказом № 84 отделение физического воспитания продолжило свою деятельность как самостоятельный факультет и З.С.Бойматов был назначендеканом факультета.

С августа 2015 годафункционирует кафедра «Начальной военной подготовки». В настоящее время на факультете 4 кафедры: «Общеуниверситетская кафедра физического воспитания» (зав.кафедрой Собиров Р.Р.), «Кафедра гражданской обороны» (зав.кафедрой Хидиров Х), «Кафедра физического воспитания и методики преподавания» (зав.кафедрой Абдурахмонов Г.З) и кафедра «Начальной военной подготовки» ( зав.кафедрой Джамолов А.Дж)